Het Deputaatschap Bijzonderen Noden van de Gereformeerde Gemeenten (sinds 2014) financiert enkele kostenposten van Karunia’s hogeschool:
De hulpverleningsorganisatie van de Protestantse Kerk Nederland (sinds 2019) verleent directe steun aan Karunia’s hogeschool bij het openen van de pabo, haar derde studierichting:
Word & Deed, een christelijke ontwikkelingsorganisatie uit de VS en Canada (sinds 2017) heeft inmiddels een hechte relatie opgebouwd met de lokale organisatie in Papoea en financiert: